【產品名稱】
通用名稱:牛腺病毒3型(BAV-3)核酸檢測試劑盒(熒光-PCR法)
Name :Bovine Adenovirus Detection Kit(Real-Time PCR Method)
【包裝規格】48T/盒
【預期用途】
牛腺病毒3型(BAV-3)是引起牛呼吸道疾病的主要病原體之一,特別是新生犢牛。臨床癥狀包括發燒,呼吸困難,鼻腔和眼結膜有分泌物等。病理變化主要舉行阿玉肺部,具有鮮明的肺小葉wei縮、肺氣腫和突變。血清學調查表明該病廣泛分布于世界各地,給養牛業造成巨大經濟損失。
本試劑盒適用于檢測肺組織、呼吸道及眼鼻分泌物等樣本中的牛腺病毒3型,用于牛腺病毒3型感染的輔助診斷。
【檢驗原理】
本試劑盒采用TaqMan探針法實時熒光PCR技術,根據牛腺病毒3型基因保守區設計特異性引物和探針,用熒光PCR技術對牛腺病毒3型的核酸進行體外擴增檢測,用于臨床上對可疑感染者的病原學診斷。
【試劑組成】
名 稱 | 規 格 |
核酸提取液 | 1.5mL×2管 |
酶液 | 50μL×1管 |
BAV-3反應液 | 1.0mL×1管 |
BAV-3陽性質控品 | 50μL×1管 |
陰性質控品 | 250μL×1管 |
注:不同批號試劑不能混用。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融次數不超過5次,有效期12個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【標本采集】
捕殺牛:取肺部病變組織,5g;活牛:用滅菌棉拭子沾取牛氣管或眼鼻分泌物,然后置于裝有0.5mL生理鹽水的離心管中。
【保存和運輸】
上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標本運送應采用2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1. 樣品處理(樣本處理區)
1.1 樣本前處理
組織樣品:稱取樣品約1g,手術剪剪碎混勻后于研磨器中研磨,加入1.5mL生理鹽水后繼續研磨,待勻漿后轉至1.5mL滅菌離心管中,8000rpm離心2min,取上清液100μL于1.5mL滅菌離心管中;棉拭子:直接取100μL于1.5mL滅菌離心管中。
1.2 DNA提取
1) 對上述處理好的標本加入50μL核酸提取液,100℃恒溫處理10min,13,000 rpm離心5min,取上清液轉移至新的1.5mL EP管,-20℃保存;
2) DNA的提取也可以采用優利科(上海)生命科學有限公司生產的DNA提取試劑盒(離心柱提取法),請嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
2. 試劑配制(試劑準備區)
根據待檢測樣本總數,設所需要的PCR反應管管數為N(N=樣本數+1管陰性對照+1管陽性對照;樣品每滿7份,多配制1份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 | BAV-3反應液 | 酶液 |
用量(樣本數為N) | 20μL | 1μL |
將混合好的測試反應液分裝到PCR反應管中,21uL/管。
3. 加樣(樣本處理區)
將步驟1提取的DNA、陽性質控品、陰性質控品各取4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR擴增(核酸擴增區)
4.1 將待檢測反應管置于熒光定量PCR儀反應槽內;
4.2 設置好通道、樣品信息,反應體系設置為25μL;
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)NONE,請勿選擇ROX參比熒光。
4.3 推薦循環參數設置:
步驟 | 循環數 | 溫度 | 時間 | 收集熒光信號 |
1 | 1 cycle | 95℃ | 10min | 否 |
2 | 40 cycles | 94℃ | 15sec | 否 |
55℃ | 30sec | 是 |
5. 結果分析判定
5.1 結果分析條件設定
設置Baseline和Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現整體傾斜時,根據分析后圖像調節Baseline的start值(一般可在3~15范圍內調節)、stop值(一般可在5~20范圍內調節),以及Threshold的Value值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.1 結果判斷
陽性:檢測通道Ct值≤35,且曲線有明顯的指數增長曲線;
可疑:檢測通道35<Ct值≤38,建議重復檢測,如果檢測通道仍為35<Ct值≤38,且曲線有明顯的增長曲線,判定為陽性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測結果Ct值>38或無Ct值。
6. 質控標準
陰性質控品:Ct>38或無Ct值顯示;
陽性質控品:擴增曲線有明顯指數生長期,且Ct值≤32;
以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
7. 檢測方法的局限性
? 樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
? 樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現假陽性結果;
? 陽性對照、擴增產物泄漏,會導致假陽性結果;
? 病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
? 不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
? 試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現假陰性或定量檢測不準確的結果;
? 本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
【注意事項】
? 所有操作嚴格按照說明書進行;
? 試劑盒內各種組分使用前應自然融化,wan全混勻并短暫離心;
? 反應液應避光保存;
? 反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
? 使用一次性吸頭、一次性手套和各區專用工作服;
? 樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區進行,以免交叉污染;
? 實驗完畢后用10%次氯酸或75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
? 試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫學實驗室生物安全通則》進行處理。
【參考文獻】
[1] 于作. 牛腺病毒3型中國分離株的鑒定及全基因組序列分析[J]. 中國農業科學院, 2011.
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